De Emmerlev-kerk is een van de oudste in de regio. Het oorspronkelijke gebouw werd rond 1150 gebouwd en in de 15e eeuw werden de toren, de sacristie, het portiek en het trappenhuis van de toren gebouwd.

Vóór de Reformatie was de kerk gewijd aan St. Andreas (de apostel).

In de loop der jaren hebben er zowel binnen als buiten de kerk veranderingen plaatsgevonden. In 1863 werd onder meer een preekstoel aan de noordzijde van het schip verwijderd.

Een tijdlang stond de kerk onder de aartsdiaken van Ribe, maar vanaf 1673 behoorde zij tot het graafschap Schackenborg tot 1931, waarna zij in particulier bezit overging.

Tot 1910 was Emmerlev een onafhankelijke parochie met een eigen priester, maar van 1910 tot 1989 was het verbonden met de Hjerpsted-parochie. Sinds 1989 zijn de parochies Emmerlev en Visby samengevoegd tot één pastoraat.

In de toren hangen twee reünieklokken. Ze werden in 1921 geschonken door het Deense volk en afgeleverd door de Smithske Jernstøberier, Aalborg. De vorige klokken werden in 1917 overgedragen voor oorlogsgebruik.